课程

2018年春季课程

2017年秋季课程

下面是一个列表的所有课程。

BMI 501:生物医学信息学概论

课程描述:本课程介绍了独特的临床特征和生命科学数据和生物医学数据的表示和转换方法,信息和知识来改善人类健康。课程将提供的概述基本概念和将作为发射台到其他更有针对性的课程探索身体质量指数的计算和分析需求,以及临床信息学的研究和转化应用。半岛体育官方app苹果下载将会有三大主题:

  • 信息表示、管理和共享:生物医学数据表示和管理;标准、术语和本体如HL7、国内,snom, ICD-9;隐私、机密性和数据共享
  • 临床信息学:卫生保健环境和流程;电子健康记录和管理;临床决策;临床信息检索;临床自然语言处理。
  • 成像信息:影像医学模式;DICOM和pac系统;计算机辅助诊断;数字病理;分析病理成像。课程将为参与者提供实践作业熟悉的概念。

先决条件:毕业生站在体重指数或导师的许可。

教材:爱德华·h·Shortliffe詹姆斯·j·西米洛:生物医学信息学:计算机应用在卫生保健和生物医学(卫生信息学)。施普林格;第3版(2012年3月23日)。

BMI 502:生命科学生物医学信息学

课程描述:本课程介绍了基本的人类细胞生物学、生物化学、遗传学和细胞/器官生理机能。细胞的生化和分子基础结构、能量代谢、基因调控、遗传,和发展进行了讨论,是细胞膜的结构和功能、细胞的生理细胞信号传导,细胞呼吸,体内平衡的器官和个人。可用于硕士或博士学位学分BMI只许可而不是除了BMI 503。不能用于生物医学信息学证书学分。

先决条件:毕业生站在体重指数或导师的许可。

BMI 503:计算机科学生物医学信息学

课程描述:本课程介绍了基本原理,计算机科学与计算机编程解决问题。学生学习如何使用编半岛体育综合平台软件程语言和计算机存储和操纵数据算法和计算机是如何由操作系统和网络控制。软件工程、数据抽象和数据库管理系统。应用包括计算机图形学和人工智能。提出了一种计算理论。方法设计解决的问题进行了讨论。结构化编程工具提出了包括顺序和决策逻辑循环。数据和文件操作解释包括处理数组排序、栈、队列、链表、二叉树。面向对象编程和顺序文件的应用进行了讨论。可用于硕士或博士学位学分BMI只许可而不是除了BMI 502。 Can NOT be used for credit toward certificate in Biomedical Informatics.

先决条件:毕业生站在体重指数或导师的许可。

BMI 511:转化生物信息学

课程描述:本课程将为学生提供一个综合计算工具箱在生物医学和定量科学之间的交叉。学生将开发存储、分析和解释的方法来优化大型生物医学和基因组数据集的转换,变成主动,预测、预防和参与式健康信息。应用在生物医学/生物分子计算统计的工作知识背景下,学生将获得的能力整合这些计算工具和大数据资源在生物医学研究企业以及在临床工作流程。半岛体育官方app苹果下载因此,本课程将使参与者熟悉与一系列相关的数据处理方法生物序列生物信号从组织学图像,从矿业医疗记录全基因组关联研究(GWAS)和基因的优先级。

先决条件:体重指数501。

BMI 512:临床信息学

课程描述:本课程提供了一个全面研究的临床信息。它提供了一个全面的卫生保健系统的回顾历史上和目前。提出了临床信息学及其的法律和道德问题,其次是临床信息学概述。这包括数据内容和结构;术语和分类系统;质量、性能、利用率和风险管理;临床信息数据库;和审查统计和研究。半岛体育官方app苹果下载临床信息管理原则和理论提出了包括改变,项目,和知识管理。人力资源和财务管理的各个方面,包括报销方法给出了这些相关的临床信息。

先决条件:体重指数501。

BMI 513:成像信息

课程描述:影像信息学是一个交叉的多学科领域临床信息学、医学物理、工程、计算机和信息科学。它触动整个成像链概念,包括图像创建和收购,图像分布和管理、图像存储和检索、图像处理、分析和理解,图像可视化和解释。课程的目标是获得熟悉的术语,核心概念,和标准实践,理解当前状态的字段,使批判阅读文学和执行研究。半岛体育官方app苹果下载本课程将涵盖放射成像和病理成像。主题包括:放射成像模式、DICOM标准图像管理及PACS系统,图像交换和国内、图像处理技术、基于内容的图像检索,结构化报告和注释,图像可视化、数字病理和病理分析成像。该课程还将包括新兴技术在成像信息。

先决条件:体重指数501。

BMI 514:影像信息学分析

课程描述:本课程将给生物医学成像的概述分析方面的信息。主题包括图像可视化,提高,加工和分析,重点在医疗领域的应用。它涵盖了范围广泛的生物医学图像分析技术:图像增强、分割、登记、纹理分析、形态测量学,tractography。他们的应用程序在诊断和治疗成像将广泛讨论。课程还涵盖了广泛的图像模式:磁共振成像(它的各种亚型),计算机断层扫描,超声波,正电子发射断层扫描,单光子发射计算机断层扫描,等,强调的相互影响和融合多源信息。计算/分析将使用Matlab等语言,c++、Python、Java,等。基于测试开放源算法包如洞察力工具包。此外,软件更面向最终用户,如3 d切片机,ImageJ, FreeSurfer等也将推出。

先决条件:体重指数BMI 501年和513年。

BMI 517:当前的信号通路研究半岛体育官方app苹果下载,生物化学、疾病和组织形态

课程描述:在这个研讨会课程,学生将探索当前知识和行研究疾病的调查他们的选择,信号通路,生物化学,和组织形态。半岛体育官方app苹果下载学生学会分析和综合研究文献针半岛体育综合平台软件对特定疾病主题,提出一个可测试的假设为一个研究项目,将推动研究调半岛体育官方app苹果下载查疾病的一行或多行。学生将提供反馈对其他学生的文学评论。

先决条件:BMI 501;BMI 502(或同等);BMI 511或512或514。

BMI 520:数据分析和软件堆栈

课程描述:本课程将涵盖先进的数据分析应用程序,基础设施,和分析方法。学生将有机会真正分析(消除识别信息)医疗数据集和时空和分子数据集来自癌症研究。半岛体育官方app苹果下载每堂课将包括讨论的应用程序,基础设施,和算法。学生将论文,还会有客人来访专家的讲座。学生将参加讲座,现在和批判文章,在重大项目和团队工作的学生整个学期。学生预计将显示出高度的独立性、批判性思维、和主动性。

先决条件:毕业生站在体重指数或导师的许可。

BMI 530:软件开发在生物医学信息学

课程描述:这是一个高级主题的BMI系列,专为参与者计划开发生物信息学软件应用程序。BMI530课程分为两个部分。第一部分将提供的概述的软件开发方法在生物医学背景下,再现性,治理和可用性特别担忧。参与者将,动手实践等的使用版本控制服务(比如GitHub),协作开发模型(比如敏捷编程、极限编程、单元测试、连续的代码评审,结对编程等)和软件架构模式(如model - view - controller, MVC, Model-View-Adapter MVA)。越来越依赖于云计算基础设施和软件开发和部署的Web 3.0技术将特别关注的对象。越来越依赖于大数据资源在生物医学,和扩大使用Web计算将接近的配置类的运动项目课程的第二部分。因此,一个特定的焦点将使用代表性状态传输(representational State Transfer, REST)的架构。课程的第二部分将把这些概念付诸实践通过小型软件项目的开发。一至三人组每个项目开发团队配置开发软件,解决了参与者的问题带到课堂,最好,但不一定,贡献手稿和/或资助的研究。半岛体育官方app苹果下载

先决条件:BMI 503和编程经验,体重指数520。

BMI 540:统计方法在生物医学信息学

课程描述:最新进展在高通量实验技术生成大量的数据。为了提取见解从这样的大规模数据集,健壮的统计模型和高效的计算方法是必不可少的。本课程介绍概率和统计建模和分析方法常用在可望。基本将简要回顾和概率论课程将集中在统计建模基于真实的建设和解决生物医学数据集。的方法包括最大似然估计、贝叶斯推理,动态规划,马尔可夫模型、蒙特卡罗模拟法、分类和聚类。学生将学习使用统计项目和当地半岛体育综合平台软件相关资源,在互联网上,强调计算方面的统计模型,利用日益增长的硬件实力。完成课程后,学生将掌握先进的统计计算的应用范围广泛的生物和生物医学问题。

先决条件:BMI 501;在概率论的基本知识、算法和编程经验R / MATLAB / C / c++预计。生物学知识优先,但不是必须的。

BMI 550:临床信息学实践模式

课程描述:本课程提供详细信息的临床信息学在各种实践中设置包括医院、独立式的门诊,管理式医疗,透析,惩教设施,长期和急性心理健康,药物滥用,发育障碍,长期护理,康复,家庭健康,临终关怀,牙科,兽医,和咨询。bd体育官网直营官网临床信息学在每个设置的作用是描述对监管问题;文档;报销和资金;信息管理,包括数据流、编码和分类,计算机系统和数据集;质量改进、利用率和风险管理和法律问题;临床信息学专业的作用和变化和趋势。

先决条件:体重指数BMI 501年和512年。

在临床信息学BMI 551:案例研究

课程描述:本课程介绍病例在临床信息学基于现实生活中的挑战。批判性思维是必不可少的临床信息学专业和案例研究要求学生制定思想和行动计划,然后在课堂上,现在和捍卫自己的选择。每种情况下暴露学生复杂的临床信息的情况下,要求学生综合信息并使用临床信息学主体战略解决问题。半岛体育综合平台软件通过案例教学法有助于学生学习“缩小差距”内容知识之前和/或当前在职临床信息学课程的经验。

先决条件:体重指数BMI 501年和502年。

为临床信息学BMI 552:质量改进方法

课程描述:教卫生保健管理人员如何执行改进项目和定量测定纳入日常工作程序,形成质量improvement-oriented文化的基础。使用Minitab软件,提供了策略来收集和分析数据需要计划,执行,监控和评价医疗质量改进计划。

先决条件:BMI 512和统计课程的B级或更好。

BMI 560:个性化医疗

课程描述:本课程重点是多学科研究和临床上下文相关的卫生保健提供个性化解决方案的发展。半岛体育官方app苹果下载它将特别强调评估机会被转化和运筹学的临床设置定义个性化医疗的实际效用。半岛体育官方app苹果下载因此,临床决策支持系统(CDS)(这里)被开发为临床药物基因组学,特别是那些建立pharmacotyping药物处方,将在本课程中发挥核心作用。其内容将涵盖创新药物制剂和nanotheranostics,分子成像和签名,医学基因组学(JA2)转化纳米医学信息学,干细胞治疗方法,建模和可预测性的药物反应,pharmacogenetics-guided药物处方,儿科药物剂量,药物警戒和监管方面,伦理和成本效益问题,药物基因组学基础知识,个人基因组测序、分子诊断,以及信息化药。

先决条件:体重指数501,体重511,体重指数540。

在生物医学信息学BMI 590:独立研究

在生物医学信息学课程描述:独立研究。必须研究和定向研究委员会批准的生物医学信息学之前注册。半岛体育官方app苹果下载

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 591:独立阅读在生物医学信息学

在生物医学信息学课程描述:补充专业阅读研究生在教师的监督下。必须研究和定向研究委员会批准的生物医学信息学之前注册。半岛体育官方app苹果下载

先决条件:体重指数BMI 501年和503年。

BMI 592:生物医学信息学硕士PRE-CANDIDATES研讨会

课程描述:本课程旨在让学生们接触当前生物医学信息学研究和其他话题。半岛体育官方app苹果下载演讲者被邀请来自校园内外。

先决条件:体重指数501。

BMI 595:在生物医学信息学专题

课程描述:考试生物医学信息学专题,由一个或多个学院的成员。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 596:在生物医学信息学特殊问题

生物医学信息学课程描述:考试的特殊问题,由研究生和一个或多个成员共同进行的。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 598:在生物医学信息学硕士顶点项目

硕士课程描述:独立的顶点的项目计划和项目执行的监督下生物医学信息学教员。只开放给生物医学信息学硕士学生谁做一个顶点项目。从599年BMI学分不得用于履行要求学生在生物医学信息学谁会写硕士论文,而不是做一个顶点项目。

先决条件:毕业生站在体重指数BMI 540或导师的许可。

BMI 599:硕士研究论文半岛体育官方app苹果下载在生物医学信息学

课程描述:硕士研究论文项目的监督下生物医学信息学教半岛体育官方app苹果下载员。只开放给生物医学信息学硕士学生谁会写硕士论文。从599年BMI学分不得用于履行要求学生在生物医学信息学谁将做一个总结性课程而不是写硕士论文。

先决条件:毕业生站在体重指数BMI 540或导师的许可。

在临床信息学BMI 620:高级的主题

课程描述:每个专题的主题课程学期都会有不同,根据学生和教师的利益。高级的主题和专门的主题将讨论,特别是当前的利益。

先决条件:毕业生站在体重指数;BMI指数512,体重550,551;或许可的讲师。

在转化生物信息学BMI 622:高级的主题

课程描述:每个专题的主题课程学期都会有不同,根据学生和教师的利益。高级的主题和专门的主题将讨论,特别是当前的利益。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 625:成像信息的高级主题

课程描述:每个专题的主题课程学期都会有不同,根据学生和教师的利益。高级的主题和专门的主题将讨论,特别是当前的利益。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

在生物医学信息学BMI 690:独立研究

在生物医学信息学课程描述:独立研究。必须研究和定向研究委员会批准的生物医学信息学之前注册。半岛体育官方app苹果下载

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 691:独立阅读在生物医学信息学

在生物医学信息学课程描述:补充专业阅读研究生在教师的监督下。必须研究和定向研究委员会批准的生物医学信息学之前注册。半岛体育官方app苹果下载

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 692:生物医学信息学研讨会的候选人

课程描述:本课程旨在让学生们接触当前生物医学信息学研究和其他话题。半岛体育官方app苹果下载演讲者被邀请来自校园内外。

先决条件:候选人站在体重指数,或许可,教练,体重指数699。

BMI 695:在生物医学信息学专题

课程描述:考试生物医学信息学专题,由一个或多个学院的成员。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 696:在生物医学信息学特殊问题

生物医学信息学课程描述:考试的特殊问题,由研究生和一个或多个成员共同进行的。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 697:我实习教学

课程描述:介绍生物医学信息学教学,包括课程设计、学习理论、教学评价和教学技术。半岛体育综合平台软件

先决条件:候选人站在体重指数,或老师的许可。

BMI 698:教学实习

课程描述:研究生协助教师教学进行背诵或实验室部分补充课课程。

先决条件:BMI 697或许可的讲师。

BMI 699:论文研究——校园半岛体育官方app苹果下载

课程描述::独立研究校园生物医学信息学的监督下教员支持的博士论文。半岛体育官方app苹果下载许可登记需要教员监督协议的研究。半岛体育官方app苹果下载可能重复。

先决条件:毕业生站在体重指数BMI 501年,540年BMI,和下列之一:BMI指数511,体重指数512,或者514或许可的讲师。

BMI 700:论文研究——校外,国内半岛体育官方app苹果下载

课程描述:独立研究了校园,在美国,一个生物医学信息学的监督下教员半岛体育官方app苹果下载支持博士论文。许可登记需要教员监督协议的研究。半岛体育官方app苹果下载可能重复。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 701:论文研究——校外,国际半岛体育官方app苹果下载

课程描述:独立研究校外,美国以外的监督下生物医学信息学教员支持博半岛体育官方app苹果下载士论文。许可登记需要教员监督协议的研究。半岛体育官方app苹果下载可能重复。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。

BMI 800:全职夏季研究半岛体育官方app苹果下载

课程描述:独立研究的监督下进行生物医学信息学教员支持博士论文。半岛体育官方app苹果下载许可登记需要教员监督协议的研究。半岛体育官方app苹果下载可能重复。

先决条件:毕业生站在体重指数,或老师的许可。