乔尔·萨尔兹

乔尔·萨尔兹博士是一个领导者在先进的信息技术为大规模数据科学半岛体育官方app苹果下载研究和生物医学/科学研究。他开发了创新的病理信息的方法,包括:第一个发表整个幻灯片虚拟显微镜系统;病理学先驱计算机辅助诊断技术;和方法将病理图像分解为功能和这些特性与癌症的“组学”,对治疗的反应和结果。他在大数据发展的新天地filter-stream DataCutter系统为基础,使用映射-规约模式风格活跃数据存储库和inspector-executor运行时编译器框架。他还在临床信息学的积极贡献者,在开发预测模型对医院再次入院的护理实验室检测质量保证系统、决策支持系统为电泳解释和图形用户界面支持临床数据仓库查询。bd体育官网直营官网沙尔茨博士一直在建立生物医学信息学领域的先驱;他创立了生物医学信息学和建造了两个非常成功的部门,一个俄亥俄州立大学和埃默里大学之一。2013年,他来到石溪副总裁临床信息学和生物医学信息学主席成立部门,创造一个活的实验室生物医学信息学和创建第三个独特的生物医学信息学部门会住在医学院和工学院。沙尔茨博士是训练的一名计算机科学家,医生通过MSTP计划杜克大学。 He has deep experience in computer science, having served on the computer science faculties at Yale University and the University of Maryland. He completed his residency in clinical pathology at Johns Hopkins University and he is a practicing, board-certified clinical pathologist.

2021年,乔·萨尔兹博士被任命为实验室项目和数字医学副主席 病理学系的。

萨尔兹博士是数字病理发展的先锋工具,方法和算法的最终目标提取和利用数字化病理信息,更好地预测癌症的结果和引导癌症治疗。他也是高端计算和专家开发了多种高度引用的系统软件的方法。

他在病理半岛体育官方app苹果下载学研究跨越二十年,由紧密协调的努力在图像分析,机器学习,数据库设计和高端计算。半岛体育综合平台软件他发明了工具和方法通过多年的资助项目支持的各种机构和机构包括NCI, NLM, NIBIB, NSF, DARPA, AFOSR, NASA,国防部和能源部。他的开创性工作在数字成像奠定了基础为数字病理今天。他是第一个开发“虚拟显微镜”,开创了发展数字病理整体滑动图像导航、数据管理和计算机辅助分类。

萨尔兹博士最初的努力包括第一整个幻灯片图像查看器的发展,和制定有效的方法管理、缓存和支持进行分析整个数据集。这项工作成为新领域的基础病理图像信息,今天调查他可以找到指导全国进行激动人心的研究机构。半岛体育官方app苹果下载

多年来,萨尔兹博士开发了一组丰富的病理信息工具、方法和算法。例如,他和他的团队最近开发一组丰富的管道来计算各种生物的重要病理特征,包括空间的地图肿瘤浸润淋巴细胞(尖)。尖的量化是有据可查的预后价值在许多地方;了解病人的免疫反应肿瘤与癌症免疫疗法的发展越来越重要。对于大多数癌症类型,病理学家不评论尖在癌症的报告甚至直到评论有时,他们只使用高水平的术语如“快步”或“稀疏”。萨尔茨能够精确地量化肿瘤浸润淋巴细胞百分比,也能够产生详细直到地图。他利用这些方法来生成公开整个幻灯片直到地图和空间统计13癌症和5000例——这些都可以在癌症成像存档。他现在是扩展和利用这些方法在许多其他的研究,以及对NCI SEER程序。

萨尔兹博士和合作者也开发了多种机器学习方法目标分析整个幻灯片的图像。半岛体育综合平台软件这包括各种方法这一目标神经母细胞瘤的分类以及方法能够利用粗粒度的整个幻灯片通过结合缀块卷积神经网络训练数据融合与监督的决定。他取得的成果在预测脑和肺肿瘤的亚型。萨尔茨还开发了创新的进行数据的计算方法和计算具有挑战性的图像分析和机器学习方法在整个幻灯片病理图像。半岛体育综合平台软件这些方法能够利用高度可伸缩的混合CPU / GPU的体系结构,能够利用云提供的功能和领导阶层架构包括橡树岭国家实验室峰会平台。

最后,萨尔茨数据科学发展做出了基础性贡献创新的移动数据计算的方法,开发的一个非常早期的原型map / reduce类型框架,基本适应应用程序的运行时编译器分析方法和分析关键数据结构采用空间数据的管理(希尔伯特空间曲线)。

乔尔·萨尔兹收到了他的医学和计算机科学博士学位的医学科学家杜克大学培训项目。他的专业是约翰霍普金斯医学院和临床病理学上的约翰霍普金斯大学教员教授和主任病理信息。他推出了石溪分校的生物医学信息学的新部门,艾莫利大学和俄亥俄州立大学,也曾在耶鲁大学计算机科学教授和马里兰大学学院公园。

乔尔·萨尔兹,Dimitris萨马拉斯,Tahsin Kurc,曹国伟Chen,音译)王石溪分校的数字病理组织形式。这个紧密整合的研究小组的目标发展的人工智能和机器半岛体育官方app苹果下载学习算法,数值方法、软件工具和数据库架构的数字病理和多尺度组织分析。半岛体育综合平台软件

1。萨尔兹J,沙玛,艾耶G,布雷默E, F王,Jasniewski, DiPrima写T,阿尔梅达JS,高Y,赵T,萨尔兹米,Kurc T .代集装箱软件系统,管理和探索功能从整个幻灯片组织图像。癌症研究。20半岛体育官方app苹果下载17年11月1日;PMID 77 (21): 29092946;PMCID: PMC5987533

2。库珀洛杉矶,香港J,古特曼哒,王F,高J, Appin C, Cholleti年代,潘T,沙玛,Scarpace L,米凯尔森T, Kurc T,莫雷诺CS,乳臭未干的DJ,萨尔兹JH。综合形态学分析疾病亚型的识别和表征。美国医学信息学协会杂志》:JAMIA 19日,317 - 323 doi: 10.1136 / amiajnl - 2011 - 000700 (2012)。PMID: 22278382;PMCID: PMC3277636

3所示。萨尔兹,J。古普塔,R。侯,L。Kurc, T。辛格,P。阮,V。萨马拉斯,D。Shroyer,投资者赵,T。巴蒂斯特、r和Van Arnam J。,2018年。空间组织和分子相关的肿瘤浸润淋巴细胞病理学图像上使用深度学习。半岛体育综合平台软件 Cell reports, 23(1), p.181. DOI: 10.1016/j.celrep.2018.03.086 PMCID: PMC5943714

4所示。侯,L。萨马拉斯,D。Kurc, T。,GaoY., Davis, J., Saltz,J., Patch-based Convolutional Neural Network for Whole Slide Tissue Image Classification. In Proceedings of the IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2016), Las Vegas, NV

5。香港,j . et al .基于机器的形态学分析使用张幻灯片胶质母细胞瘤的病理图像揭示临床相关分子相关。e81049 PloS one 8日,doi: 10.1371 / journal.pone。0081049 (2013)。

6。Cooper,洛杉矶等。综合形态学分析疾病亚型的识别和表征。美国医学信息学协会杂志》:JAMIA 19日,317 - 323 doi: 10.1136 / amiajnl - 2011 - 000700 (2012)。

7所示。Cooper,洛杉矶等。肿瘤微环境强烈影响主基因转录监管机构和expressiocn胶质母细胞瘤。180年美国病理学杂志》,2108 - 2119 doi: 10.1016 / j.ajpath.2012.01.040 (2012)。

8。Cooper,洛杉矶等。在硅神经胶质瘤研究的综合疗法。半岛体育官方app苹果下载IEEE生物医学工程57,2617 - 2621 doi: 10.1109 / tbme.2010.2060338 (2010)。

9。月亮,B。Jagadish, h V。、凯利、c和萨尔兹,j·h·希尔伯特空间的聚类性质的分析曲线。知识和数据工程,IEEE 124 - 141 (2001)。

10。Kurc, T。Catalyurek U。常,C。苏斯曼,a &萨尔兹,j .大型数据集的可视化与活跃的数据存储库。计算机图形学和应用程序,IEEE 21日- 33 (2001)。

11。Beynon, m . d . et al .分布式处理与DataCutter非常大的数据集。并行计算27,1457 - 1478 (2001)。

12。萨尔兹,j . H。,r &克劳利Mirchandaney k .运行时并行化和调度循环。电脑,IEEE 603 - 612 (1991)。